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鳄龟是下蛋较多的爬行动物，每次能下20~90个蛋。它的蛋是白色的，在强烈的太阳光照射下很容易孵化。
大鳄龟和小鳄龟的繁殖习性不完全一样，交配期小鳄龟在美国为4~11月，卵性，在中国长江中下游地区产卵期5~8月(高温地区可提前和延长产卵时间)，一般每次产卵15~40枚，实际情况根据亲龟的大小和发育程度而变化，在生殖季节解剖可见4千克体重的亲龟怀卵量80枚，其中硬壳卵20枚。1年多次产卵。笔者见过9千克的亲龟年产卵110枚，全部受精并孵出稚龟。
大鳄龟在美国交配期为2~4月，产卵期4~6月，每次产卵10~52枚。在自然条件下，大鳄龟和小鳄龟卵的孵化期为9~18星期，天气较冷及干燥孵化期会较长。人工控温可缩短鳄龟卵的孵化期，恒温32℃经60天左右就可孵出鳄龟。
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